宇宙世紀 0087 年地球連邦軍のエリート組織「ティターンズ」と反地球連邦組織「エゥーゴ」の内戦は続いていたエゥーゴに身を投じたカミーユは地球降下作戦後エゥーゴの支援組織「カラバ」のハヤト・コバヤシらと接触ティターンズの追撃をかわしつつ再び宇宙へと還る機会をうかがっていた
そんな折り補給のために立ち寄ったニューホンコンでカミーユは神秘的な少女フォウと運命的な出会いをするだがフォウはティターンズの強化人間禁じられた二人の出会いはカミーユの心を愛と苦悩に引き裂く哀しみに満ちた戦いの果てフォウは決死の覚悟でカミーユを宇宙へと送り出す
宇宙へと戻ったカミーユを待ち受ける激しさを増した戦場と新型モビルスーツＺゼータガンダムだった非道なコロニー落とし作戦や月面都市への爆弾テロなど激しさを増すティターンズの戦法そして大きく変転を始める政治状況エゥーゴは指導者ブレックス准将を暗殺で失い一方ティターンズ内部では木星帰りの男シロッコが勢力を拡大しつつあった……
そしてついに動きを見せ始める第三勢力――それは旧ジオン軍の残党アクシズだったカミーユの新たな力Ｚガンダムが混迷の戦場を切り裂いて飛ぶ
